Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap), organismo de cuarentena en la Unión Europea, causante de la mancha bacteriana de los frutales de hueso y almendro, fue detectada por primera vez en España en 2002. En el análisis multilocus de secuencias de las cepas españolas de Xanthomonas asociadas a esta enfermedad, se han identificado algunas de ellas que no presentaban un patrón típico de Xap y que no se consideraron pertenecientes a dicho patovar (denominadas Xap “looka-like”). En estas cepas, sin embargo, el gen de un transportador tipo ABC, generalmente usado para la identificación de Xap, fue amplificado por PCR en tiempo real con cebadores específicos de su secuencia. Por otro lado, en un análisis de efectores de virulencia de los patovares de la especie X. arboricola se determinó que un efector de tipo III (xopE3) estaba presente únicamente en Xap. Combinando la PCR basada en el transportador ABC para la detección de Xap y diseñando cebadores para el gen xopE3, se desarrolló un nuevo protocolo de PCR en tiempo real para el diagnóstico de la enfermedad y la detección e identificación de Xap. Para evitar el efecto de inhibidores de la PCR, se incluyó un paso previo de separación inmunomagnética con antisueros obtenidos frente a Xap. En este trabajo se presentan los resultados de la selección de los antisueros utilizados en la inmunocaptura, así como los de la sensibilidad y especificidad del protocolo de PCR en tiempo real desarrollado, que resultó apropiada para la detección de Xap, ya que amplificaron las 48 cepas ensayadas procedentes de distintos orígenes.
