La Sede Regional de Guanacaste de la Universidad de Costa Rica nació como Centro Universitario Regional de Guanacaste a inicios de 1972, gracias a las múltiples luchas que encabezaron los grupos comunales en los años sesenta, que buscaban atraer la educación superior a la provincia. En aquel momento, el objetivo principal del nuevo Centro Universitario de Guanacaste era ofrecer carreras cortas y programas de extensión docente, diseñados en relación con las necesidades de la región, y que pudiera funcionar también como centro de transferencia para aquellos estudiantes que estuvieran interesados en continuar sus estudios superiores en San José.
A la Sede de Guanacaste le corresponde asumir un papel protagónico que se ajuste a los nuevos tiempos, modificando su oferta académica y realizando inversiones importantes en infraestructura para aumentar su cobertura. La oferta académica actual incluye las carreras de Agronomía, Administración Aduanera y Comercio Exterior, Educación, Derecho, Dirección de Negocios, Informática Empresarial, Inglés, Ingeniería Eléctrica, Psicología y Turismo Ecológico.