En el Laboratorio de Ecología Urbana se investiga la interrelación entre una serie de factores humanos, bióticos y abióticos en las ciudades. El estudio integral de estos ecosistemas da herramientas a la sociedad para la toma de decisiones que lleven hacia el establecimiento de un ambiente sano y sostenible.

El Laboratorio de Ecología Urbana se creó en julio del 2008 como una unidad de investigación, pero se vincula estrechamente con la docencia y la extensión universitaria. Estudiantes, principalmente, de la Maestría Académica en Manejo de Recursos Naturales, obtienen apoyo y guía en el desarrollo de sus tesis. Además, se hace un esfuerzo por llevar los resultados de las investigaciones a la comunidad científica, al público en general y a tomadores de decisiones como son los consejos municipales.