La población en Nicaragua ha sido considerada tradicional e históricamente como producto del mestizaje. Se analizaron un total de 100 nicaragüenses provenientes de distintas localidades y residentes en Costa Rica, con el propósito de estimar la magnitud de proceso de mezcla. Para tal efecto se examinaron 6 loci utilizando la PCR (LDLR, GYPA. HBGG, D7S8, GC y HLA-DQA1). Se estimaron los componentes de la mezcla mediante el método de identidad génica de Chakraborty con un enfoque no ponderado. Las proporciones de genes de origen europeo, amerindio y africano son respectivamente 46,88%, 36,83% y 16,29%. Se concluye que la población nicaragüense es incuestionablemente tribibrida. El análisis de distancias génicas muestra que Nicaragua es cercana a otras poblaciones hispano-mestizas tales como Chile, Colombia, Costa Rica y a los hispanos de Estados Unidos, las cuales difieren en las proporciones del flujo génico de las poblaciones ancestrales.
