Misión: Contribuir con el mejoramiento de la salud y la calidad de vida de los costarricenses, mediante el desarrollo de programas de vigilancia y control de la calidad del agua en sus diferentes usos.

Visión: El Laboratorio Nacional de Aguas será el centro de referencia de análisis para la vigilancia y control de la calidad del agua en todo el país y a nivel centroamericano.